大陸高校欠缺有影響力的國際學術大師
值得注意的是，這一排名設置了校友和教師獲得諾貝爾獎和數學菲爾茲獎數量的指標。四地有三所大學培養過諾獎得主：1957年諾貝爾物理學獎獲得者楊振寧1944年畢業于清華大學(西南聯大清華研究院)，1986年諾貝爾化學獎獲得者李遠哲曾在臺灣大學取得學士學位(1959)、在清華大學(新竹)取得碩士學位(1961)。李政道和丘成桐因沒有取得過國內大學學位而不計。香港中文大學是兩岸四地大學中唯一一個有教師在本校獲得諾貝爾獎或菲爾茲獎的大學，其前校長高錕獲2009年諾貝爾物理學獎。
論文被引次數是國際上公認的反映學術研究影響力的主要指標。在湯森路透公司“高被引科學家”數據庫統計公布的近三十年來在21個學科內全世界論文被引次數最高的6000余名科研人員中，香港科技大學、臺灣大學、香港大學等港臺高校都有多名高被引科學家，而大陸僅有中國科學技術大學等個別學校有1名。
雖然大陸絕大多數大學已要求新聘教師具有博士學位，但目前大陸高校教師隊伍整體質量顯然尚有待提高。排名榜中。有博士學位的教師比例占教師總數90%以上的10所大學，全部是港臺大學，其他進入排名的港臺大學的博士學位教師比例大多在80%以上，而大陸地區只有北京師范大學(微博)一所學校博士教師比例超過80%。
科研能力：港臺高校師均表現領先
按近五年在《自然》和《科學》兩本國際頂尖刊物上發表的論文數看，前三名分別是北京大學、中國科學技術大學和南京大學，全部是大陸高校，前十名(11所)中大陸大學有7所；但是，師均發表論文最多的是臺灣的陽明大學，前十名中大陸高校只有3所。
年度發表SCIE和SSCI論文最多的是浙江大學，前十名中大陸高校有8所；但是師均發表此類論文的前十名大學中，大陸高校只有1所，其它9所全部是港臺高校。
清華大學(北京)的國際專利數量位居兩岸四地大學之首，但是師均數僅位列第六位。除清華大學(北京)外，沒有其它大陸高校能夠進入國際專利總量和師均數的前十名。清華大學(北京)以近25億人民幣的數額位列“年度科研經費”第一，前十名中大陸高校有6所；但師均科研經費中最高的是香港大學，接近200萬人民幣，前十名中大陸大學只有2所。
香港高校的辦學經費顯然最充裕。辦學總經費和生均經費排名第一的都是香港大學，生均經費排名前十名的大學中香港的大學有7所，總經費排名前十的大學中香港的大學有4所。大陸地區的清華大學(北京)和臺灣地區的臺灣大學的辦學總經費和生均辦學經費排名也比較靠前。
